Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SBK1Q52WX2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SBK1Q52WX2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SBK1Q52WX2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms