Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARHGAP29Q52LW3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGAP29Q52LW3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms