Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GREB1Q4ZG55 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GREB1Q4ZG55 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms