Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
KRTAP20-2Q3LI61 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
KRTAP20-2Q3LI61 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.32
KRTAP20-2Q3LI61 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
KRTAP20-2Q3LI61 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
KRTAP20-2Q3LI61 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms