Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TWISTNBQ3B726 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TWISTNBQ3B726 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TWISTNBQ3B726 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms