Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDO1Q16878 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDO1Q16878 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDO1Q16878 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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