Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ATP6V1FQ16864 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATP6V1FQ16864 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms