Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRNQ16849 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRNQ16849 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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