Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPP1Q16831 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPP1Q16831 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms