Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXD1Q16676 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
FOXD1Q16676 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FOXD1Q16676 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXD1Q16676 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
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