Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP7Q16576 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RBBP7Q16576 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBBP7Q16576 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms