Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDC37Q16543 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDC37Q16543 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDC37Q16543 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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