Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PKN1Q16512 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PKN1Q16512 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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