Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NTRK3Q16288 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NTRK3Q16288 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NTRK3Q16288 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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