Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ATP6AP1Q15904 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP6AP1Q15904 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP6AP1Q15904 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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