Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USF2Q15853 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USF2Q15853 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USF2Q15853 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USF2Q15853 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USF2Q15853 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USF2Q15853 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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