Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NPTX1Q15818 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NPTX1Q15818 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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