Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNHIT3Q15649 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNHIT3Q15649 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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