Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAM1Q15629 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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TRAM1Q15629 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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TRAM1Q15629 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAM1Q15629 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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