Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRADDQ15628 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRADDQ15628 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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