Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCEA2Q15560 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCEA2Q15560 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCEA2Q15560 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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