Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB3GAP1Q15042 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB3GAP1Q15042 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
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