Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN4

KRT72, Keratin, type II cytoskeletal 72, humanhuman

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT72Q14CN4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT72Q14CN4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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KRT72Q14CN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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KRT72Q14CN4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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KRT72Q14CN4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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KRT72Q14CN4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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KRT72Q14CN4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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KRT72Q14CN4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT72Q14CN4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms