Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1I3Q14994 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1I3Q14994 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1I3Q14994 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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