Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

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Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN2CQ14957 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN2CQ14957 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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