Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CHD4Q14839 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CHD4Q14839 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
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