Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RBM39Q14498 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM39Q14498 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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