Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPIDRQ14159 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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SPIDRQ14159 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPIDRQ14159 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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