Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNIQ14094 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCNIQ14094 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNIQ14094 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCNIQ14094 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms