Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CIRBPQ14011 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CIRBPQ14011 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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