Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CACNA1CQ13936 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CACNA1CQ13936 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
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