Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTB1Q13884 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTB1Q13884 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNTB1Q13884 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNTB1Q13884 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNTB1Q13884 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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