Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA7Q13683 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ITGA7Q13683 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms