Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CUL1Q13616 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CUL1Q13616 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CUL1Q13616 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms