Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA5AQ13591 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA5AQ13591 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA5AQ13591 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms