Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC1Q13547 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC1Q13547 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC1Q13547 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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