Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TOP3AQ13472 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TOP3AQ13472 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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