Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SF3B2Q13435 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SF3B2Q13435 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SF3B2Q13435 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
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