Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SP140Q13342 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SP140Q13342 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SP140Q13342 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SP140Q13342 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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SP140Q13342 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SP140Q13342 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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SP140Q13342 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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SP140Q13342 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP140Q13342 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP140Q13342 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP140Q13342 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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SP140Q13342 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP140Q13342 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SP140Q13342 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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SP140Q13342 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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SP140Q13342 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP140Q13342 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SP140Q13342 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP140Q13342 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP140Q13342 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP140Q13342 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP140Q13342 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SP140Q13342 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SP140Q13342 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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