Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SKP2Q13309 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
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SKP2Q13309 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SKP2Q13309 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SKP2Q13309 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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