Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RESTQ13127 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RESTQ13127 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RESTQ13127 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RESTQ13127 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RESTQ13127 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RESTQ13127 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RESTQ13127 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RESTQ13127 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RESTQ13127 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RESTQ13127 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RESTQ13127 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RESTQ13127 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RESTQ13127 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RESTQ13127 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RESTQ13127 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RESTQ13127 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RESTQ13127 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RESTQ13127 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RESTQ13127 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RESTQ13127 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RESTQ13127 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RESTQ13127 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RESTQ13127 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RESTQ13127 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RESTQ13127 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RESTQ13127 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RESTQ13127 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RESTQ13127 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RESTQ13127 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RESTQ13127 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RESTQ13127 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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