Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACACAQ13085 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACACAQ13085 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ACACAQ13085 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACACAQ13085 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACACAQ13085 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACACAQ13085 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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