Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFSWAPQ12872 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFSWAPQ12872 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFSWAPQ12872 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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