Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TFCP2Q12800 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TFCP2Q12800 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TFCP2Q12800 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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