Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CPSF1Q10570 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
CPSF1Q10570 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CPSF1Q10570 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
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