Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFFO1Q0D2I5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IFFO1Q0D2I5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFFO1Q0D2I5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms