Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP3CAQ08209 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP3CAQ08209 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP3CAQ08209 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms