Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 UQCC1-203ENST00000374380 2133 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.258e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-201ENST00000349714 2188 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NCKAP1L-206ENST00000548980 562 ntTSL 213.21□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-202ENST00000359226 2036 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.328e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DHX29-205ENST00000621106 4450 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-212ENST00000443429 692 ntTSL 512.42□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZBTB34-201ENST00000319119 6564 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-205ENST00000374385 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.488e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF431-207ENST00000600692 1971 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.58e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-201ENST00000378927 1258 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 C8orf44-204ENST00000521113 575 ntTSL 211.67□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PARD6G-AS1-202ENST00000586421 3333 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF431-205ENST00000598331 1082 ntTSL 511.64□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 VPS53-220ENST00000576149 2444 ntTSL 511.5□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 511.27□□□□□ -0.618e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-207ENST00000491614 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.668e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 510.95□□□□□ -0.668e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PKP4-216ENST00000495123 580 ntTSL 510.63□□□□□ -0.718e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DHX29-201ENST00000251636 4502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-205ENST00000433298 977 ntTSL 510.52□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 C8orf44-SGK3-201ENST00000519289 2949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.88e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.818e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-222ENST00000497717 471 ntTSL 59.97□□□□□ -0.818e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.838e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 UQCC1-211ENST00000438533 736 ntTSL 39.77□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-202ENST00000418472 961 ntTSL 59.74□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-215ENST00000476664 227 ntTSL 39.58□□□□□ -0.888e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CLSPN-205ENST00000517467 553 ntTSL 39.25□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF106-204ENST00000565500 4733 ntTSL 1 (best)9.16□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-204ENST00000428136 3205 ntTSL 59.01□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-204ENST00000378952 917 ntTSL 59□□□□□ -0.978e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 VPS53-213ENST00000572334 561 ntTSL 58.82□□□□□ -18e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.038e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-208ENST00000578596 560 ntTSL 58.53□□□□□ -1.048e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 VPS53-212ENST00000572259 683 ntTSL 38.32□□□□□ -1.088e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP2-209ENST00000493302 358 ntTSL 57.95□□□□□ -1.148e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.168e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 NUDT5-205ENST00000444732 410 ntTSL 37.71□□□□□ -1.188e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 DYM-218ENST00000583353 554 ntTSL 47.4□□□□□ -1.228e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 C8orf44-SGK3-202ENST00000520044 628 ntTSL 36.88□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.418e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-214ENST00000473177 520 ntTSL 46.03□□□□□ -1.448e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.458e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.458e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 IGF2BP3-209ENST00000474105 663 ntTSL 45.9□□□□□ -1.468e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 RIF1-207ENST00000454583 3552 ntTSL 25.86□□□□□ -1.472e-6■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PIK3CB-206ENST00000469284 3164 ntTSL 55.71□□□□□ -1.56e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.548e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-213ENST00000471667 586 ntTSL 45.18□□□□□ -1.588e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 PKP4-212ENST00000483881 452 ntTSL 24.86□□□□□ -1.638e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 LRCH3-209ENST00000452660 681 ntTSL 54.67□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 RNF213-212ENST00000570776 544 ntTSL 210.2□□□□□ -0.781e-26■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CUL1-203ENST00000602748 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CUL1-202ENST00000409469 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.479e-7■■■■■ 27.8
FMR1Q06787 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.312e-6■■■■■ 27.7
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FMR1Q06787 USP47-205ENST00000525257 548 ntTSL 431.42■■■□□ 2.621e-9■■■■■ 27.7
FMR1Q06787 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 27.7
FMR1Q06787 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 27.7
FMR1Q06787 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.121e-9■■■■■ 27.7
FMR1Q06787 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.419e-7■■■■■ 27.7
FMR1Q06787 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 513.31□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 27.6
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FMR1Q06787 FLNB-207ENST00000470231 315 ntTSL 1 (best)18.37■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 27.6
FMR1Q06787 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)11.17□□□□□ -0.623e-28■■■■■ 27.6
FMR1Q06787 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 27.5
FMR1Q06787 SART1-204ENST00000529532 1471 ntTSL 223.94■■□□□ 1.421e-7■■■■■ 27.5
FMR1Q06787 NUP188-205ENST00000477069 2941 ntTSL 1 (best)13.11□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 27.5
FMR1Q06787 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.212e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 PI4KB-205ENST00000430800 965 ntTSL 519.11■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 PI4KB-202ENST00000368873 3340 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 MYBBP1A-202ENST00000381556 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 XAB2-204ENST00000600230 749 ntTSL 318.98■□□□□ 0.635e-8■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 KIAA0100-209ENST00000580395 577 ntTSL 210.6□□□□□ -0.714e-8■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 HDAC6-232ENST00000489053 539 ntTSL 411.38□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 HDAC6-223ENST00000480525 412 ntTSL 36.05□□□□□ -1.443e-7■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 TLN1-208ENST00000495712 370 ntTSL 29.61□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 27.4
FMR1Q06787 DOCK8-202ENST00000382331 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 524.95■■□□□ 1.581e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 224.5■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-208ENST00000578473 2482 ntTSL 1 (best)24.25■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.371e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-206ENST00000577509 1912 ntTSL 223.2■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.31e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-211ENST00000579893 558 ntTSL 422.75■■□□□ 1.231e-6■■■■■ 27.3
FMR1Q06787 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 27.3
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