Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTF1Q05048 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSTF1Q05048 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSTF1Q05048 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms