Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARDQ03181 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARDQ03181 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms